通常导致药物变质的外界因素主要有阳光、空气、温度、湿度、真菌、害虫六大因素。

在日光照射下，有些药物常会发生一些化学变化，一些含色素的药物容易改变颜色而影响质量；含挥发油的药物，可因日光照射而加速挥发油的散失，以导致降低质量。另外，还有一些药物，如维生素D，长时间受光照的话，会发生化学反应而生成有毒的物质。所以阳光是导致药物变质的一个重要因素。贮存药品前，应尽量存放在阳光不能直接照射的地方，且通常采用深色的容器贮藏。

空气中的氧气和二氧化碳常可影响许多药物的质量，例如肾上腺素、苯酚、乙醚等在空气中极易被氧化而变质；有些含有挥发油的药物，在空气中容易挥发，如麝香等；一些含挥发油、脂肪、糖类的药物在空气中容易被氧化，会出现浸油状的变质现象，习称泛油，如当归、柏子仁、麦冬等；又如氯石灰（漂白粉）在有湿气存在的条件下，可以吸收空气中的二氧化碳，放出氯气，而使药物变质。因此，贮藏这些药物时，通常应按规定的条件密封保存。

温度是造成药物变质的常见因素之一。一般在室温25℃时，含糖及黏液质的药物容易变质及发霉、生虫，含脂肪的药物则容易酸败，如糖参、玉竹、杏仁等；动物胶类药材及干燥叶汁在30摄氏度或湿度过大时，会变软进而黏结甚至融化，呈粘稠流体状的变质现象，如阿胶、芦荟等；含有挥发性成分的药物，如含挥发油的生药——丁香、桂皮、细辛、薄荷等，都要避免受高温影响；各种生物制剂、酶制剂、疫苗血清等药品必须在较低的温度下贮存，温度过高会使其蛋白质变性而使药效变低。

在潮湿的空气中，药物可以吸收空气中的水分，发生霉变或分解。如相对湿度达75%时，含淀粉、黏液质、糖类的药物及炒焦、炒炭的药物容易吸收空气中的水分而分解变质或促使真菌生长，如山药、地黄等。无机盐类结晶形矿物药材，在相对湿度达75%以上时，会吸收空气中的水分而部分溶化，习称潮解；在相对湿度低于45%时，由于空气干燥，逐渐失去结晶水变成非结晶形粉末，习称风化，如芒硝等。又如糖衣片吸水后，糖衣会变色；糖浆剂在湿度较大的环境中易发霉、生虫；粉末药物受潮则易粘连成块。

通常在一定的温度和湿度条件下，真菌很容易生长。真菌能促使多数药物分解变质，失去疗效。尤其是富含营养的药物较易生霉，如淡豆豉等，这类药物必须妥善保管。

害虫对于药物的影响，主要体现在一些中药材上，在适宜的温度下，一些药材携带的虫卵会被孵化，导致药材发生虫蛀。虫蛀会使药材气味流失，降低疗效；而且害虫将虫尸、粪便留在孔洞内，会污染药材。在贮藏药物时应注意防虫。